以钟南山为首的专家组一边指导救治全省病人，一边研究探讨治疗方案。3月9日，省卫生厅印发了凝聚他们大量心血的《广东省医院收治非典型肺炎病人工作指引》，再一次明确了诊断标准、治疗方案和出院标准，使各个医院都有章可循，大大促进了医院救治工作。目前，全省已有1000多名患者治愈出院，超过患者总数的80%.4月3日，世界卫生组织派出的专家组到广东考察。他们第一时间就与钟南山见面。一番交流和探讨之后，他们竖起大拇指说，钟南山收集的病例资料非常详细，也非常多，以他为首的广东专家摸索出来的治疗经验，对全世界抗击非典型肺炎有指导意义。
“非典”病因扑朔迷离，令钟南山心急如焚，他深深明白作为科学家的责任，忘我地投入关于“非典”的科研中。救治“非典”病人，专家们遇到的最大的难题是该病发病急，病情变化快，规律很难捉摸，而且没有现成的治疗经验可以参考。为了攻克难关，钟南山带着呼研所专家不断就病人的病情展开研讨，在临床上严密观察病人的变化，细致地记录各种可供研究的参数，翻阅各类资料文献，上网搜索相关的病例，只要能从中查出一点关于这种疾病治疗方法的“蛛丝马迹”，就马上召集大家研究讨论。
探索是艰辛的。钟南山经常夜不能寐，书房的灯光也亮彻通宵。功夫不负有心人，经过大量的研究，他们终于摸索出一套行之有效的治疗方法。但病原体的寻找迟迟没有突破。
对于病因，有人怀疑是衣原体感染。但根据以往的经验，假如是衣原体感染，患者应该有上呼吸道炎症。为了作出准确判断，钟南山亲自观察病人的口腔，得出所有病例均无上呼吸道感染的结论，对广东及时制定救治方案提供了重要的决策依据。军团菌？不是。禽流感？炭疽？鼠疫？都不是。一个又一个可能性被排除了。
钟南山通过各种途径寻找病因。他想到了与香港合作。香港搞了十几年的流感、禽流感研究，积累了丰富的经验。2月上旬，在广州市科技局及卫生局的领导下，钟南山牵头广州地区的有关专家，与香港大学医学院微生物学系共同合作，成立了“广州非典型肺炎流行病学、病原学及临床诊治课题小组”。
合作终于取得突破。4月初，他们拿出了成果。在对40余例非典型肺炎患者的呼吸道分泌物及双份血清检测中，已分离出2株冠状病毒，经检测初步认定：冠状病毒极可能是本次广东“非典”的重要病原，虽然此次发现的冠状病毒与人类以前所知道的不同，但从形态学意义看，可断定为一种新的冠状病毒。
4月16日，世界卫生组织负责传染病的执行干事戴维。海曼宣布，经过全球科研人员的通力合作，终于正式确认冠状病毒的一个变种是引起非典型肺炎的病原体。在全球合作中，钟南山是一位始终处在治疗一线，科研方向清晰，治学严谨又富有协作精神的巨擘。
但这时候的钟南山在国内毕竟名声不显，王兆祥听陈锋推崇钟南山，便不由有些奇怪的反问道：“哦，你凭什么这么肯定？”
“爷爷，我刚才说了，我的直觉，你听我的，肯定不会有错的。”陈锋加强语气道。
王兆祥不由听得一乐，笑道：“小锋，你真的这么肯定？”
“是的，爷爷，我很肯定，我的直觉一向都很灵验的，要不然当初我怎么可能建立华腾集团？”
王兆祥闻言倒是重视了起来，连忙说道：“那好吧，爷爷就相信你，找人了解一下这位名叫钟南山的院士。”
陈锋闻言不由催促道：“好，这件事，越快越好，我相信在国内，也就钟院士能拿出行之有效的治疗方案出来。”
“嗯，爷爷知道了，先这么说，爷爷还有事情要忙。”
王兆祥说完后，就挂了电话。而陈锋此时，脑海中则在不断的回忆着前世有关非典的记忆。其中也是有关于钟南山的：2003年2月，钟南山院士勇敢地否定了卫生部所属国家疾病预防控制中心关于“典型衣原体是非典型肺炎病因”的观点，为广东卫生行政部门及时制定救治方案提供了决策论据。在此之前，卫生部国家疾病控制中心宣称在广东送去的两例死亡病例的肺组织标本切片里，用电子显微镜看到了非常典型和清楚的衣原体颗粒图像，其他如支原体、立克次体等也会引起非典型肺炎的病原体都没有发现。衣原体是一种体积比细菌小、比病毒大的第三类微生物，也是呼吸道疾病的常见致病原因或继发原因之一，也可以引起“非典型肺炎”。看电镜的专家是中国最权威的电子显微镜专家洪涛院士。稍有医疗常识的人都知道，在医院长期使用各种药物治疗的呼吸道疾病病人中，很多是后来继发感染衣原体的，这两个病人已经死亡，他们可能合并有多种病原体感染，只是衣原体在尸体上存活的时间较长而被检出。
历史中的那天晚上中央台的《新闻联播》正式宣布：“中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所报告，通过电镜观察发现两份死于本次肺炎病人的尸检肺标本上有典型的衣原体包含体，肺细胞浆内衣原体颗粒十分典型。广东省部分地区非典型肺炎的病原基本确定为衣原体。”晚上8时07分，新华社正式报道：“引起广东部分地区非典型肺炎的病原基本可确定为衣原体。”权威部门结论，通过权威媒体发布出来。这个消息公布后，很多人都意识到了事态严重性：如果按照衣原体的推荐特效药四环素及红霉类抗生素来治疗，治疗方案将大大简化，但如果“衣原体说”是错误的，我们可能将付出病人的生命代价。
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